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基于生物信息学分析Midkine在胆管癌中的表达及其对预后的预测价值

谷月月 于书敏 常秀娟 高旭东 黄加干 贾晓东 曾珍

段愿, 张婷, 张婧, 等 . AU富集元件结合因子1(AUF1)在肝细胞癌中的表达及预后评估价值[J]. 临床肝胆病杂志, 2024, 40(9): 1833-1839. DOI: 10.12449/JCH240918.
引用本文: 段愿, 张婷, 张婧, 等 . AU富集元件结合因子1(AUF1)在肝细胞癌中的表达及预后评估价值[J]. 临床肝胆病杂志, 2024, 40(9): 1833-1839. DOI: 10.12449/JCH240918.
DUAN Y, ZHANG T, ZHANG J, et al. Expression of AU-rich element RNA-binding factor 1 in hepatocellular carcinoma and its value in prognostic evaluation[J]. J Clin Hepatol, 2024, 40(9): 1833-1839. DOI: 10.12449/JCH240918.
Citation: DUAN Y, ZHANG T, ZHANG J, et al. Expression of AU-rich element RNA-binding factor 1 in hepatocellular carcinoma and its value in prognostic evaluation[J]. J Clin Hepatol, 2024, 40(9): 1833-1839. DOI: 10.12449/JCH240918.

基于生物信息学分析Midkine在胆管癌中的表达及其对预后的预测价值

DOI: 10.12449/JCH240722
基金项目: 

国家“十三五”科技重大专项课题 (2018ZX10725-506-002);

国家卫生健康委医药卫生科技发展研究中心 (WKZX2023CX020011);

北京市自然科学基金 (7222172)

伦理学声明:本研究方案于2022年12月14日经由中国人民解放军总医院第五医学中心伦理委员会审批,批号:KY-2022-12-76-1,所纳入患者均签署知情同意书。
利益冲突声明:本文不存在任何利益冲突。
作者贡献声明:谷月月负责课题设计,资料分析,撰写论文;于书敏、常秀娟、高旭东、黄加干、贾晓东参与收集数据,修改论文;曾珍负责拟定写作思路,指导撰写文章并最后定稿。
详细信息
    通信作者:

    曾珍, zengzhen1970@sina.com (ORCID: 0000-0002-1574-7196)

Expression of Midkine in cholangiocarcinoma and its value in predicting prognosis based on bioinformatics analysis

Research funding: 

National Science and Technology Major Project of China (2018ZX10725-506-002);

National Health Commission Medical and Health Science and Technology Development Research Center (WKZX2023CX020011);

Beijing Municipal Natural Science Foundation (7222172)

More Information
  • 摘要:   目的  研究中期因子(MDK)在胆管癌(CCA)中的表达及其对患者预后的预测价值,探索MDK可能影响CCA进展的机制。  方法  从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取CCA样本数据信息,分析MDK在癌与癌旁组织中的表达差异及其与临床特征的相关性,使用基因表达综合数据库(GEO)和解放军总医院第五医学中心2018年6月—2021年9月经手术切除的11例CCA患者的临床资料进行相关验证。通过STRING和Cytoscape构建蛋白互作网络,使用基因本体(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)进行富集分析,探讨MDK相关基因所参与的生物学过程和肿瘤相关通路。此外,应用TIMER和TISIDB数据库分析CCA肿瘤组织中MDK的表达与免疫细胞浸润的相关性。计量资料两组间比较采用成组t检验或Mann-Whitney U检验。计数资料组间比较采用Fisher精确概率法。应用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,并采用Log-rank检验进行组间比较。两变量间的相关性采用Spearman相关性分析。  结果  比较TCGA数据库中CCA患者肿瘤组织及癌旁组织中MDK的表达水平,非配对分析结果和配对分析结果均显示,MDK在CCA肿瘤组织中的表达水平高于癌旁组织(P值均<0.001);对纳入的11例CCA患者肿瘤组织及其配对癌旁组织标本进行转录组测序,结果显示,MDK在CCA肿瘤组织中的表达水平显著高于其配对癌旁组织(P<0.01)。MDK高表达与淋巴结转移(P=0.045)和血管侵犯(P=0.044)有关。生存分析显示,MDK高表达的CCA患者总生存期(χ2=5.30,P=0.028)及疾病特异性生存期(χ2=6.25,P=0.019)均明显短于MDK低表达的患者。GO和KEGG富集分析显示,MDK表达相关的30个基因与泛素介导的蛋白质水解过程密切相关,并影响CCA患者预后;TIMER分析结果显示,MDK表达与B淋巴细胞(r=0.356,P=0.035 6)和树突状细胞(r=0.409,P=0.014 7)在肿瘤组织微环境中的浸润呈正相关;TISIDB分析结果显示,MDK表达水平与CXCL16(r=0.465,P=0.004 67)呈正相关,与CXCL12(r=-0.389,P=0.019 7)及CXCR5(r=-0.393,P=0.018 5)呈负相关;与免疫检查点调节剂VTCN1(r=-0.393,P=0.018 3)、LTA(r=-0.380,P=0.022 7)和PVR(r=-0.350,P=0.037 3)呈负相关。  结论  MDK高表达提示CCA患者预后不佳,MDK有潜力成为预测CCA患者预后的分子标志物,其可能通过调控泛素介导的蛋白质水解过程及调控B淋巴细胞和树突状细胞的浸润促进CCA的发生发展。

     

  • 原发性肝癌是目前全球第六大常见癌症,也是导致癌症相关死亡的第三大常见原因1,其中肝细胞癌(HCC)占75%~85%。由于HCC发病隐匿,进展迅速,高达80%的HCC患者在首次诊断时已处于中晚期,5年生存率不足15%2。因此,亟需探明HCC发生发展的分子机制,为HCC早期诊断和精准治疗提供靶点。AU富集元件结合因子1(AU-rich element RNA-binding factor 1,AUF1)是真核细胞中重要的转录后调节因子3。AUF1通过与mRNA的AU元件富集区结合,调控多种mRNA的稳定性及翻译,其异常表达与炎症、衰老、发育异常和心血管疾病等密切相关4-6。AUF1也是一种潜在的致癌因子,在多种肿瘤的发生发展中发挥重要作用7-8,但AUF1在肿瘤发生发展中的作用机制尚未完全阐明。本研究利用UALCAN和TCGA-HCC数据库分析AUF1在包括HCC在内的多种肿瘤组织中的表达以及AUF1表达与HCC患者预后的相关性,并分析AUF1对肝癌细胞增殖、凋亡、迁移能力的影响及可能机制,以期为阐明AUF1在HCC进展中发挥的作用及分子机制提供依据。

    siAUF1和对照siNC购自广州锐博生物;pCDH-AUF1及对照质粒(pCDH)为本实验室构建保存;细胞DMEM培养基、胎牛血清和胰蛋白酶购自美国Gibco公司;转染试剂Lipo fectamineTM RNAiMAX Transfection Reagent、Lipo fectamineTM 2000试剂购自美国Invitrogen公司;鼠抗E-cadherin购自美国BD transduction laboratories公司;鼠抗N-cadherin购自美国Santa Cruz公司;兔抗AUF1抗体和兔抗β-cateinin购自英国Abcam公司;鼠抗人β-tubulin抗体和蛋白定量试剂购自北京普利莱公司;兔抗β-actin购自美国CST公司;CCK-8试剂盒、Annexin V-FITC试剂盒购自日本Dojindo公司。

    HepG2细胞购自美国ATCC细胞库,Huh7和Huh1细胞购自中国科学院上海细胞库。使用含有10%胎牛血清、100 U/mL青霉素、链霉素的DMEM培养基于37 ℃,5% CO2的培养箱中培养,待细胞融合度达约80%时,用0.25%胰蛋白酶进行消化传代,取生长至对数期的细胞用于实验研究。

    采用UALCAN数据库分析AUF1在泛癌中的表达9-10;采用TCGA-HCC数据库分析AUF1表达与HCC患者临床病理特征及预后的相关性。

    转染前24 h进行细胞传代并计数,按照3.5×105个/孔将细胞接种于6孔板中。按照Lipo fectamineTM RNAiMAX Transfection Reagent的说明书,将siAUF1或对照siNC转染至HepG2、Huh7或Huh1细胞中。pCDH-AUF1和对照质粒按照Lipo fectamineTM 2000说明书进行转染。转染4~6 h后,更换为新鲜的DMEM完全培养基继续培养,并于转染48 h后收集细胞,用于后续实验研究。

    收集细胞沉淀,加入RIPA裂解液进行细胞裂解,使用BCA法测定蛋白浓度。SDS-PAGE电泳分离蛋白,转移至PVDF膜,5%脱脂牛奶室温封闭,4 ℃孵育一抗过夜。室温孵育二抗1 h。用美国LI-COR公司Odyssey双色红外激光成像系统采集图像,使用β-tubulin或β-actin作为内参。

    在96孔板上以8×103细胞/孔的密度接种细胞。每组设置6个复孔。分别在接种后的0、1、2、3、4、5天在每孔加入含有10 μL CCK-8的100 μL培养基,37 ℃孵育1 h。在450 nm波长下测量吸光度,根据吸光度绘制生长曲线。

    取得转染24 h后的细胞悬液,PBS清洗去除血清,再用无血清DMEM培养基重悬细胞,将其均匀加入小室中(5×103/200 μL)。在24孔板中加入600 μL含10% FBS的DMEM培养基,镊子夹取小室平稳放入其中,培养36 h。PBS清洗小室及24孔板,经固定、染色后,去除小室中残留的水分及未穿过小室聚碳酸酯膜的细胞。风干,显微镜下拍照。

    将4×105个细胞/孔置于6孔板中培养48 h,消化离心后弃上清,使用PBS冲洗细胞沉淀2遍,加入300 μL结合缓冲液重悬细胞。加入5 μL Annexin V-FITC和5 μL PI,室温避光孵育15 min,并使用流式细胞仪检测。

    本文数据下载自GEO数据库GSE162706数据集11。Hisat212和featureCounts13用于读图和基因计数计算。edgeR软件14用于基因差异表达分析。

    采用FPKM(fragmenls per kilobasemillion)法对TCCA转录组测序数据进行标准化,最终纳入预后分析的HCC样本来自于370例不同病因的HCC患者。使用R语言进行统计学分析及绘图。计量资料两组间比较采用t检验。采用Kaplan-Meier绘图仪数据库(http://www.kmplot.com)评估肝癌患者AUF1表达与无复发生存率之间的关系,并使用Log-rank检验进行生存率比较。P<0.05为差异有统计学意义。

    利用UALCAN数据库分析AUF1在24种肿瘤和相对应正常组织中的mRNA表达情况(图1a)。与正常组织相比,AUF1 mRNA水平在膀胱尿路上皮癌(BLCA)、乳腺癌(BRCA)、胆管癌(CHOL)、结肠癌(COAD)、食管癌(ESCA)、多形性胶质母细胞细胞瘤(GBM)、头颈鳞状细胞癌(HNSC)、肾透明细胞癌(KIRC)、HCC、肺腺癌(LUAD)、肺鳞癌(LUSC)、前列腺癌(PRAD)、胃癌(STAD)中高表达(P值均<0.05),但在肾嫌色细胞癌(KICH)和甲状腺癌(THCA)中则呈低表达(P值均<0.05)。除此之外,本研究利用UALCAN数据库分析AUF1蛋白在10种肿瘤组织中的表达情况。结果显示,AUF1蛋白在9种肿瘤组织中表达升高(图1b),包括BRCA、COAD、卵巢癌(OV)、肾透明细胞癌(ccRCC)、子宫内膜样癌(UCEC)、肺癌(LUNG)、HNSC、GBM、HCC(P值均<0.05),而在胰腺癌(PAAD)中AUF1蛋白水平降低(P值均<0.05)。综上结果显示,AUF1的mRNA和蛋白水平在HCC、BRCA、COAD、GBM、HNSC中均显著上调,提示AUF1可能在包括HCC在内的多种肿瘤中发挥促癌作用。

    注: a,AUF1 mRNA水平;b,AUF1蛋白水平。
    图  1  AUF1在泛癌组织中的表达水平
    Figure  1.  The expression of AUF1 in pan-cancer

    为进一步探究AUF1与肝癌的关系,本研究分析TCGA-HCC数据库中AUF1表达水平与HCC患者临床病理特征的关系。结果显示,AUF1与肿瘤恶性标志物MKI67的表达水平呈正相关(r=0.552 2,P<0.000 1)(图2a)。在不同肝癌Edmondson-Steiner分级中,AUF1 mRNA水平在3级肿瘤中的表达高于1级和2级(P值均<0.000 1)(图2b)。在临床不同TNM分期患者中,AUF1在TNM-Ⅲ期肿瘤组织中的表达水平高于TNM-Ⅰ(P<0.000 1)(图2c)。但无论是Edmondson-Steiner分级还是TNM分期中,4级或TNM-Ⅳ期肝癌组织中AUF1的表达均未见升高。本研究进一步根据TNM分期分别对AUF1表达水平在HCC中的预后能力进行评估。Kaplan-Meier生存分析显示,在早期(Ⅰ‍~‍Ⅱ期)肝癌中,AUF1高表达患者的半数生存期仅为30.1个月,显著低于AUF1低表达患者的半数生存期55.87个月(P=0.048)(图2d)。AUF1表达水平与中晚期肝癌(Ⅲ~Ⅳ期)的半数生存期无相关性(P>0.05)。上述结果提示,AUF1的异常表达可能参与HCC的发生和发展,是早期肝癌诊断和预后的潜在标志物。

    注: a,AUF1与MKI67 mRNA水平的相关性曲线;b,不同肝癌组织分级中AUF1 mRNA表达水平分析;c,不同TNM分期肝癌组织中AUF1表达水平分析;d,HCC Ⅰ‍~‍Ⅱ期中AUF1高表达和低表达患者的生存分析。
    图  2  AUF1在肝癌组织中的表达及预后分析
    Figure  2.  Expression and prognostic value of AUF1 in patients with HCC

    为探究AUF1对肝癌细胞增殖能力的影响,本研究在肝癌细胞系中分别敲减或过表达AUF1,并通过CCK-8实验检测细胞的增殖能力。结果显示,与siNC对照组相比,转染AUF1 siRNA后,HepG2和Huh1细胞中AUF1蛋白水平明显降低(图3a),且敲减AUF1后HepG2和Huh1细胞增殖能力明显低于对照组(图3b)。与敲减结果一致,过表达AUF1的HepG2和Huh7(图3c)细胞增殖能力明显高于pCDH对照组(图3d)。

    注: a,Western Blot检测siAUF1的敲减效果;b,CCK-8实验检测AUF1敲减对细胞增殖能力的影响;c,Western Blot检测AUF1的过表达效果;d,CCK-8实验检测AUF1过表达对细胞增殖能力的影响。每24 h检测实验组和对照组在450 nm处吸光度并进行比较。
    图  3  AUF1对肝癌细胞增殖能力的影响
    Figure  3.  The effect of AUF1 on the proliferation ability of hepatocellular carcinoma cells

    本研究进一步使用Annexin V/PI双染色法评价AUF1对肝癌细胞凋亡的影响。结果显示,与对照siNC组相比,敲减AUF1后HepG2细胞和Huh1细胞中Annexin V单阳性和Annexin V/PI双阳性细胞比例明显上调,表明细胞的早期和晚期凋亡率增加(图4a)。而在过表达AUF1的HepG2和Huh7细胞中,细胞的早期和晚期凋亡率较pCDH对照组则显著降低(图4b)。

    注: a,流式细胞术检测敲减AUF1后HepG2和Huh1细胞的凋亡率;b,流式细胞术检测过表达AUF1后HepG2和Huh7细胞的凋亡率。
    图  4  AUF1对肝癌细胞凋亡的影响
    Figure  4.  The effect of AUF1 on apoptosis of hepatocellular carcinoma cells

    本研究随后检测AUF1对肝癌细胞迁移能力的影响。Transwell迁移实验结果显示,与对照siNC组相比,AUF1敲减可增强HepG2和Huh1细胞的迁移能力(图5a)。Western Blot检测结果显示,AUF1敲减后E-cadherin水平降低、N-cadherin水平升高(图5b)。与此结果一致,过表达AUF1后Huh7细胞的迁移能力较对照质粒pCDH组降低(图5c),细胞内的E-cadherin蛋白水平升高、N-cadherin蛋白水平降低(图5d)。

    注: a,Transwell实验检测AUF1敲减对细胞迁移能力的影响(结晶紫染色,×20);b,Western Blot检测AUF1敲减对E-cadherin和N-cadherin水平的影响;c,Transwell实验检测AUF1过表达对细胞迁移能力的影响(结晶紫染色,×20);d,Western Blot检测AUF1过表达对E-cadherin和N-cadherin水平的影响。
    图  5  AUF1对肝癌细胞迁移能力的影响
    Figure  5.  The effect of AUF1 on the migration ability of hepatocellular carcinoma cells

    为探究AUF1促癌的潜在机制,本研究通过转录组测序(RNA-seq)分析AUF1敲减对HepG2细胞转录组的影响。利用cuffdiff分析模块进行基因差异表达分析,并根据差异倍数和P值进行筛选,共获得467个差异基因。其中162个基因在AUF1敲减后表达上调,305个基因表达显著下调(图6a)。进一步对这些AUF1相关差异基因进行KEGG pathway分析,如结果所示,主要富集在Wnt信号通路、细胞黏附因子、5-羟色氨酸突触、花生四烯酸代谢等多种通路上,其中Wnt信号通路富集到的差异基因数排在前列(图6b)。

    注: a,AUF1差异基因分布火山图;b,KEGG pathway富集柱状图,不同颜色代表不同KEGG通路的一级分类,其中黑色代表环境信息处理相关信号通路,灰色代表有机系统相关通路,条纹代表代谢相关通路;c,Western Blot检测β-catenin蛋白水平。
    图  6  AUF1敲减对肝癌细胞基因功能的影响
    Figure  6.  The effect of AUF1 knockdown on gene function in hepatocellular carcinoma cells

    β-catenin蛋白上调是Wnt通路活化的重要标志。本研究进一步通过Western Blot实验检测肝癌细胞内β-catenin蛋白水平。结果显示,敲减AUF1后HepG2中的β-catenin蛋白下调。而过表达AUF1后β-catenin蛋白上调(图6c)。上述结果提示AUF1可以通过上调β-catenin激活肝癌细胞中的Wnt信号通路。

    AUF1的异常表达与多种肿瘤的发生发展相关,但多数相关研究均基于RNA水平检测,缺少AUF1蛋白水平检测。本研究利用UALCAN数据库,系统分析了泛癌转录组学和蛋白质组学数据中AUF1 mRNA和蛋白在多种肿瘤中的表达情况。本研究发现,与AUF1 mRNA水平一致,AUF1蛋白水平在多种肿瘤组织中亦呈高表达,提示其在这些肿瘤中发挥促癌作用。但在PAAD中,AUF1的mRNA或蛋白水平均降低,提示AUF1的异常表达与不同肿瘤类型有关。

    前期通过检测配对的HBV肝癌组织与癌旁组织发现,AUF1在肝癌组织中高表达,并与患者的预后不良有关15。本研究利用TCGA-HCC数据库,进一步证实AUF1在肝癌组织中高表达,且其表达水平与MKI67、Edmondson-Steiner分级、TNM分期等多项肿瘤恶性病理学指标正相关。更为重要的是,本研究发现AUF1表达水平随着肝癌分期逐步上调,但在晚期(Ⅳ期)不再继续升高。生存分析结果也显示AUF1对肝癌早期(Ⅰ‍~‍Ⅱ期)更有预后价值。体外实验证实AUF1能促进肝癌细胞增殖、抑制肝癌细胞凋亡和迁移。有报道16AKR1B10、c-Myc等癌基因在肝癌早期发挥促癌作用,且具有抑制细胞迁移的能力。因此,笔者推测AUF1异常表达可能与肝癌的早期进展有关,是肝癌早期诊断和预后的一个重要指标。

    Wnt/β-catenin通路是一种高度保守且严格控制的信号通路,可调节胚胎发育、细胞增殖和分化。越来越多证据表明Wnt信号通路的异常激活促进肝癌增殖17。据报道18,在约49%的HCC病例中可检测到β-catenin的活化。β-catenin已经被公认为原发性肝癌中最常见的突变基因之一。本研究在HepG2细胞系中敲减AUF1后进行转录组测序,将差异基因进行富集分析,发现差异基因功能富集最显著的是Wnt信号通路,并进一步通过细胞实验证明AUF1激活Wnt通路。本研究发现AUF1敲减后差异基因富集在Wnt通路,Western Blot检测也证实AUF1能够上调β-catenin蛋白水平,提示AUF1通过激活Wnt/β-catenin通路发挥促癌作用。但AUF1激活Wnt通路的具体机制目前尚未明确。笔者团队前期研究发现,AUF1也可以转录后调控AKR1B10、AFP表达。有文献19报道AKR1B10在乳腺癌中高表达,并通过激活Wnt/β-catenin通路促进乳腺癌细胞增殖。但在肝细胞癌中,AUF1是否也可通过转录后调控AKR1B10表达进而激活Wnt/β-catenin通路,尚需更多实验验证。

    综上所述,本研究证实AUF1在多种肿瘤组织中呈异常表达;AUF1在肝癌组织中的表达水平与肝癌恶性程度以及早期肝癌的不良预后呈正相关;AUF1具有促进肝癌细胞增殖、抑制肝癌细胞凋亡和转移的作用,可能与其激活Wnt信号通路有关。

  • 注: a,MDK在CCA中表达情况的非配对分析(TCGA数据库);b,MDK在CCA中表达情况的配对分析(TCGA数据库);c,MDK在11例CCA患者中表达情况的配对分析(临床病例);d,MDK在CCA中表达情况的配对分析(GSE132305数据集)。

    图  1  MDK在CCA患者癌组织和癌旁组织中的表达情况

    Figure  1.  The expression level of MDK in cancerous and paracancerous tissues of CCA patients

    注: a,不同MDK表达水平患者的总生存期比较;b,不同MDK表达水平患者的疾病特异性生存期比较。

    图  2  CCA患者MDK表达与预后分析

    Figure  2.  The survival analysis of the prognostic significance of MDK expression in cholangiocarcinoma patients

    注: a,MDK诊断CCA的ROC曲线;b,时间依赖性ROC曲线;c,预后列线图。

    图  3  MDK在CCA中的诊断和预后价值

    Figure  3.  The diagnostic and prognostic value of MDK expression in cholangiocarcinoma

    注: a,与MDK表达正相关的前25个基因热图;b,与MDK表达负相关的前25个基因热图;c,MDK相关基因功能富集分析;d、e,MDK相关基因和CCA生存相关基因韦恩图及功能富集分析;f,MDK相关基因相互作用网络;g,MDK相关基因之间的相关性热图。

    图  4  MDK相关基因的功能聚类及互作网络分析

    Figure  4.  MDK functional clustering and interaction network analysis of MDK-related genes

    图  5  CCA肿瘤组织中MDK表达与肿瘤浸润免疫细胞的相关性

    Figure  5.  The correlation between MDK expression and tumor-infiltrating immune cells in cholangiocarcinoma

    注: a,肿瘤组织中MDK表达与趋化因子相关性热图;b,肿瘤组织中MDK表达与趋化因子受体相关性热图;c~e,CCA中MDK表达与CXCL16、CXCL12及CXCR5相关。

    图  6  CCA肿瘤组织中MDK表达与趋化因子和趋化因子受体的相关性分析

    Figure  6.  Correlation analysis between MDK expression and chemokines and chemokine receptors in CCA tumor tissue

    注: a,肿瘤组织中MDK表达与免疫抑制剂的相关性热图;b,肿瘤组织中MDK表达与免疫增强剂的相关性热图;c~e,CCA中MDK表达与VTCN1、LTA及PVR相关。

    图  7  CCA肿瘤组织中MDK表达与免疫抑制剂和免疫增强剂的相关性分析

    Figure  7.  Correlation analysis between MDK expression and immunoinhibitors and immunostimulators in CCA tumor tissue

    表  1  TCGA数据库中MDK表达与CCA患者临床特征的关系

    Table  1.   The relationship of MDK expression and clinical characteristics in patients with cholangiocarcinoma from TCGA

    临床指标 低表达(n=17) 高表达(n=18) P
    T分期[例(%)] >0.05
    T1期 9(52.9) 9(50.0)
    T2期 6(35.3) 6(33.3)
    T3/T4期 2(11.8) 3(16.7)
    淋巴结转移[例(%)]1) 0.045
    14(100.0) 11(68.8)
    0(0.0) 5(31.3)
    M分期[例(%)]2) >0.05
    M0期 13(86.7) 14(82.4)
    M1期 2(13.3) 3(17.6)
    性别[例(%)] >0.05
    9(52.9) 10(55.6)
    8(47.1) 8(44.4)
    年龄[例(%)] 0.318
    ≤65岁 10(58.8) 7(38.9)
    >65岁 7(41.2) 11(61.1)
    BMI[例(%)]3) >0.05
    ≤25 kg/m2 5(31.3) 5(27.8)
    >25 kg/m2 11(68.8) 13(72.2)
    血管侵犯[例(%)]4) 0.044
    16(100.0) 12(70.6)
    0(0.0) 5(29.4)
    注:1) MDK低表达组3例患者数据缺失,高表达组2例患者数据缺失;2) MDK低表达组2例患者数据缺失,高表达组1例患者数据缺失;3) MDK低表达组1例患者数据缺失;4) MDK低表达组和高表达组各有1例患者数据缺失。
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    表  2  临床收集的11例CCA患者肿瘤组织中MDK的表达与临床特征参数的关系

    Table  2.   The relationship of MDK expression and clinical characteristics in 11 patients with cholangiocarcinoma

    临床指标 例数 MDK表达水平 t P
    年龄 0.567 0.586
    ≤60岁 7 3.71±1.95
    >60岁 4 4.18±0.77
    性别 1.487 0.171
    5 4.62±1.05
    6 3.27±1.78
    BMI 2.543 0.075
    ≤25 kg/m2 7 3.15±1.47
    >25 kg/m2 4 5.17±0.74
    肿瘤直径 0.538 0.601
    ≤5 cm 3 3.39±0.88
    >5 cm 8 4.07±1.80
    肿瘤数目 1.146 0.282
    单发 3 3.00±1.44
    多发 8 4.22±1.59
    淋巴结转移 2.416 0.039
    3 2.34±1.72
    8 4.47±1.15
    血管侵犯 0.578 0.577
    9 4.02±1.41
    2 3.28±2.88
    下载: 导出CSV

    表  3  TCGA数据库中CCA患者的单因素Cox回归分析

    Table  3.   Univariate Cox regression analyses of cholangiocarcinoma from TCGA

    参数 例数 HR(95%CI P
    T分期
    T1/T2期 30 1.000
    T3/T4期 5 0.615(0.140~2.700) 0.520
    淋巴结转移1)
    25 1.000
    5 2.147(0.565~8.154) 0.262
    M分期2)
    M0期 27 1.000
    M1期 5 1.531(0.428~5.475) 0.513
    年龄
    ≤65岁 17 1.000
    >65岁 18 1.461(0.570~3.747) 0.430
    性别
    19 1.000
    16 1.279(0.503~3.255) 0.605
    BMI3)
    ≤25 kg/m2 10 1.000
    >25 kg/m2 24 0.552(0.200~1.527) 0.253
    血管侵犯4)
    28 1.000
    5 1.665(0.461~6.012) 0.436
    神经侵犯5)
    25 1.000
    7 4.056(1.128~14.582) 0.032
    MDK
    低表达 17 1.000
    高表达 18 3.374(1.141~9.976) 0.028
    注:1) 5例患者淋巴结转移数据缺失;2) 3例患者M分期数据缺失;3) 1例患者BMI数据缺失;4) 2例患者血管侵犯数据缺失;5) 3例患者神经侵犯数据缺失。
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  • 收稿日期:  2024-02-01
  • 录用日期:  2024-04-25
  • 出版日期:  2024-07-25
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