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Expression of long non-coding RNA H19 in serum in patients with acute pancreatitis and its clinical significance
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摘要: 目的探讨急性胰腺炎患者血清中长链非编码RNA（lncRNA）H19的表达及临床意义。方法选取2013年1月-2015年12月在沈阳市急救中心急诊科及综合外科诊断为急性胰腺炎的患者82例以及健康者20例。采集急性胰腺炎患者及健康者的外周血,分离血清提取RNA,利用Real-time PCR检测lncRNA H19的表达水平,分析H19的表达与其他临床病理指标的关系。计量资料组间比较采用t检验,计数资料组间比较采用χ2检验;利用受试者工作特征曲线（ROC曲线）分析lncRNA H19对急性胰腺炎的诊断价值。结果急性胰腺炎患者急性期血清中的lncRNA H19表达水平明显高于健康对照组,差异有统计学意义（t=2.364,P=0.020）;重型急性胰腺炎组患者比轻型急性胰腺炎组lncRNA H19表达水平高（t=2.111,P=0.037）,Balthazar CT分级>C级患者的lncRNA H19表达水平高于CT分级≤C级的患者,且差异有统计学意义（t=2.312,P=0.022）。ROC曲线分析显示H19的检测可以帮助诊断急性胰腺炎（ROC曲线下面积为0.75...Abstract: Objective To investigate the expression of the long non-coding RNA (lncRNA) H19 in the serum of patients with acute pancreatitis and its clinical significance.Methods A total of 82 patients who were diagnosed with acute pancreatitis in Emergency Department and Department of General Surgery in Shenyang Emergency Center from January 2013 to December 2015 were enrolled, and 20 healthy subjects were enrolled as normal controls.Peripheral blood samples were collected from the patients with acute pancreatitis and healthy subjects, the serum was separated, and RNA was extracted.Real-time PCR was used to measure the expression of lncRNA H19, and the correlation between the expression of H19 and other clinical and pathological parameters was analyzed.The t-test was used for comparison of continuous data between groups, and the chi-square test was used for comparison of categorical data between groups.The receiver operating characteristic (ROC) curve was used to evaluate the value of lncRNA H19 in the diagnosis of acute pancreatitis.Results The acute pancreatitis group had a significantly higher H19 expression level in serum than the healthy control group (t=2.364, P=0.020) .The severe acute pancreatitis group had higher expression of lncRNA H19 than the mild acute pancreatitis group (t=2.111, P=0.037) , and the patients with a Balthazar CT grade above grade C had significantly higher relative expression of lncRNA H19 than those with CT grade ≤ C (t=2.312, P=0.022) .The ROC curve showed that H19 measurement helped with the diagnosis of acute pancreatitis with an area under the ROC curve of 0.752 (95% CI:0.636-0.867, P<0.01) .Conclusion Patients with acute pancreatitis have increased expression of lncRNA H19 in serum, and therefore, H19 has certain clinical significance in the diagnosis of acute pancreatitis and the evaluation of disease severity.
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Key words:
- pancreatitis /
- RNA, untranslated /
- diagnosis
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肝性脑病(HE)是继发于肝脏严重疾病所出现的以代谢紊乱为基础、轻重程度不同的神经精神异常综合征[1-2]。轻微肝性脑病(MHE)是HE症状最轻微的阶段，可降低患者生活质量，增加显性脑病(OHE)发生率和死亡风险。慢性肝硬化患者中MHE的患病率高达80%[3]，住院肝硬化患者隐匿性HE的发病率为39.9%[4]。研究表明，肝硬化患者肠道菌群发生明显改变[5-7]，肠道菌群失调随肝硬化严重程度加重而加重[8]。OHE患者和MHE患者的肠道菌群具有特征性变化，如有益菌/原生菌群减少，而有害菌/潜在致病菌增多等[9]。
经颈静脉肝内门体分流术(TIPS)是降低门静脉压力最有效的方式之一，可显著控制再出血率，减轻腹水程度，但是HE作为TIPS术后最主要的并发症，严重影响术后患者的生活和生存质量[1]。由于缺乏重视，TIPS术前很少对患者进行MHE检测，那么MHE患者TIPS术后预后如何，是否与肠道菌群的改变有关成为一个值得探讨的问题。因此，本文通过高通量测序方法，分析TIPS术后不同预后的患者其肠道菌群与术前的差异，探索从菌群角度预防和治疗MHE患者TIPS术后脑病的新策略。
1. 资料与方法
1.1 研究对象
选取2016年7月—2017年7月在本院接受TIPS治疗的MHE患者。MHE的诊断根据中华医学会肝病学分会制定的《肝硬化肝性脑病诊疗指南》[10]，术前1~3 d及术后1个月对患者进行传统纸-笔神经心理学测试:HE心理学评分，包括数字连接试验(NCT) A、B, 数字符号试验(DST), 轨迹描绘试验, 系列打点试验5个子测试试验。若NCT-A、DST均阳性，或5个子试验中任何2项异常，即诊断为MHE。OHE诊断根据West-Haven标准及分级[11]。
1.2 纳入标准
(1) 经临床/实验室检查，影像学检查或肝活检确诊为肝硬化；(2)计划接受TIPS治疗以预防门静脉高压性静脉曲张再出血；(3)术前检测为MHE患者。
1.3 排除标准
(1) 肝脏及胃肠道恶性肿瘤；(2)术前腹泻、血便、便秘；(3)术前HE病史；(4)未控制的严重活动性感染(＞2级)或败血症；(5)严重的心、肾、肺功能不全；(6)曾接受TIPS或手术分流史；(7)布加综合征；(8)入组前3个月胃肠道手术史；(9)近期计划肝移植手术；(10)怀孕或哺乳期受试者。
1.4 研究方法
分别于术前1~3 d和术后1个月收集粪便样本及采样时临床资料信息。采样前1 d嘱患者清淡饮食，使用无菌采样管收集新鲜粪便，液氮速冻后在超净工作台上预处理，取采样管中心部位样本3~5 g于样本管中，存于实验室-80 ℃冰箱。并于采样当天记录患者的临床资料信息。根据患者术后1个月内发生HE的类型进行分组。
1.5 粪便微生物DNA提取、鉴定以及16S rRNA高通量测序
便微生物DNA提取、鉴定以及16S rRNA测序由上海态昌基因科技有限公司完成。粪便样本DNA提取采用E.Z.N.A.®Stool DNA Kit (Omega Bio-tek, Inc., 美国)，采用热循环PCR系统扩增细菌16S rRNA基因的V3-V4超变区，引物序列为338F (5′－ACTCCTACGGGAGGCAGCA－3′)和806R(5′－GGACTACHVGGGTWTCTAAT－3′)，PCR反应采用EasyCycler 96 PCR扩增仪(Analytik Jena Corp., 德国)完成。PCR扩增产物经过纯化后，安装如上扩增方法完成8个循环的index扩增反应，每个样本的index标签不重复。将产物进行纯化后，按照等摩尔比进行混合，并采用Illumina Miseq平台(Illumina Inc., 美国)根据官方说明书操作完成测序(每个粪便样本至少完成2万条测序数据)。
1.6 伦理学审查
本研究方案经由西京医院药物临床试验伦理委员会审批，批号：KY20172061-1，患者均签署知情同意书。
1.7 统计学方法
分析SPSS 19.0和R v3.6.1统计软件进行数据分析。计量资料采用M(P25~P75)表示, 3组间比较采用Kruskal-Wallis H检验，采用Bonferroni法进行多个样本的多重比较；同组患者术前术后的比较采用Wilcoxo符号秩检验。计数资料组间比较采用χ2检验。微生物组Beta分析基于Bray Curtis距离矩阵进行主坐标分析(PCoA)，使用Adonis法(PerMANOVA)对比组间差异。P＜0.05为差异有统计学意义。
2. 结果
2.1 一般资料
共纳入接受TIPS治疗的MHE患者28例，术前患者中位年龄51岁，男13例，女15例，中位MELD评分13分，Child-Pugh分级A/B/C级分别9/15/4例。根据患者术后1个月内发生HE的类型分为3组：无HE组(n=8，28.6%)、MHE组(n=12，42.8%)和OHE组(n=8，28.6%)。3组患者术前临床资料均未见明显差异(P值均＞0.05)(表 1)。
表 1 不同预后组术前基线特征比较指标 无HE组(n=8) MHE组(n=12) OHE组(n=8) χ2值 P值 年龄(岁) 49.5(45.8~52.8) 54.5(49.8~59.5) 46.5(44.3~52.8) 5.28 0.07 性别[男，例(%)] 3(37.5) 6(50.0) 4(50.0) 3.08 0.61 BMI(kg/m2) 18.7(18.3~20.7) 21.6(18.6~24.1) 21.4(19.6~23.8) 4.43 0.11 肝硬化病因[HBV，例(%)] 4(50.0) 7(58.3) 7(87.5) 7.39 0.35 MELD评分 10.9(7.8~13.2) 13.4(10.0~17.5) 13.4(12.7~14.9) 4.82 0.10 Child-Pugh分级[例(%)] 2.44 0.49 A(5~6) 4(50.0) 3(12.5) 2(25.0) B(7~9) 4(50.0) 6(50.0) 5(62.5) C(10~13) 0(0) 3(12.5) 1(12.5) INR 1.4(1.1~1.6) 1.4(1.2~1.9) 1.6(1.5~1.7) 4.92 0.10 血红蛋白(g/dl) 80.0(75.5~83.8) 87.0(79.3~94.3) 80.0(59.0~92.0) 1.69 0.43 总蛋白(mg/dl) 68.2(53.1~73.9) 68.0(55.7~78.9) 66.2(54.7~68.0) 0.83 0.66 Alb(g/dl) 36.5(30.6~39.3) 34.4(28.1~37.2) 32.7(31.4~35.5) 1.10 0.58 TBil(μmol/L) 15.2(10.6~20.6) 23.6(14.7~49.6) 28.1(20.4~36.1) 4.86 0.09 AST(U/L) 21.5(13.0~40.3) 21.0(11.3~30.0) 28.5(20.3~34.8) 1.77 0.41 ALT(U/L) 30.5(20.8~42.8) 27.5(21.0~42.5) 31.0(21.5~37.5) 0.01 0.99 ALP(U/L) 97.0(73.8~117.0) 65.5(49.8~92.8) 79.0(59.8~112.3) 3.69 0.16 γ-氨基丁酸(U/L) 32.0(21.0~45.8) 23.5(14.0~56.5) 31.0(20.0~49.0) 0.63 0.73 肌酐(mg/dl) 77.5(66.5~93.8) 85.5(73.0~105.0) 72.0(68.3~95.0) 1.46 0.48 静脉血氨(μg/dl) 51.0(21.0~60.0) 37.5(23.8~60.5) 36.0(27.5~47.5) 0.29 0.86 注：MELD，终末期肝病模型。 2.2 物种组成分析
总体患者的肠道菌群主要由5个优势菌门(平均相对丰度占比＞1%)组成：厚壁菌门(45.0%)、拟杆菌门(30.6%)、变形菌门(17.2%)、放线菌门(4.78%)和疣微菌门(1.9%)。菌门水平3组间比较无明显差异，且术后未见明显改变(P值均＞0.05)。
2.3 Alpha多样性指数分析
Alpha多样性包括Chao1指数、Ace指数、Shannon指数和Simpson指数，对比发现，术前3组患者的alpha多样性无明显差异(P值均＞0.05)(表 2)，术后各组alpha多样性无明显改变且3组间无明显差异(P值均＞0.05)。
表 2 不同预后组术前alpha多样性比较多样性指数 无HE组(n=8) MHE组(n=12) OHE组(n=8) χ2值 P值 Ace指数 186.70(137.96~232.29) 214.69(144.20~354.14) 186.68(130.79~241.34) 0.96 0.62 Chao1指数 194.64(133.60~215.46) 203.40(138.58~352.64) 183.79(118.53~208.50) 1.03 0.60 Shannon指数 2.65(2.02~3.12) 2.95(2.56~3.95) 2.67(2.04~3.50) 1.71 0.43 Simpson指数 0.16(0.09~0.23) 0.09(0.05~0.16) 0.13(0.07~0.26) 2.46 0.29 2.4 Beta多样性指数分析
基于Bray Curtis距离矩阵的PCoA分析显示，3组间beta多样性在术前和术后没有明显差异。纵向对比中，仅MHE组术前和术后的beta多样性明显改变(PerMANOVA法，F=2.71，P=0.049)(图 1)。
图 1 MHE组患者术前术后菌群beta多样性对比分析注：基于Bray Curtis距离矩阵的主坐标分析，MHE组术前术后beta多样性有统计学差异(F=2.71，P=0.049)。2.5 物种差异分析
无HE组患者TIPS术后相比术前，原生菌群小杆菌属(Z=2.521，P=0.012)、粪球菌属(Z=2.1，P=0.036)、解黄酮菌属(Z=2.1，P=0.036)、瘤胃菌科某属(Z=2.1，P=0.036)和狭义梭菌属(Z=1.96，P=0.049)相对丰度显著升高。原生菌假丁酸弧菌属(Z=1.859，P=0.063)、有害菌如丹毒丝菌科未知属(Z=1.82，P=0.069)和颗粒链菌属(Z=1.82，P=0.069)相对平度差异均无统计学意义。
MHE组患者术后部分有害菌颗粒链菌属(Z=2.521，P=0.012)、肠球菌属(Z=2.51，P=0.012)、链球菌属(Z=2.432，P=0.015)和罗氏菌属(Z=2.001，P=0.045)丰度明显减低，而部分有害菌韦荣球菌属(Z=2.353，P=0.019)和巨球菌属(Z=1.955，P=0.05)则明显升高。
对于OHE组患者，仅有韦荣球菌属(Z=2.38，P=0.017)丰度显著升高，其他菌群丰度未见明显变化(图 2)。
采用增长倍数(术后菌群相对丰度/术前菌群相对丰度，丰度为0则按10-6计算)来描述菌群术后的变化量，对比发现，粪球菌属的变化量在3组间具有明显差异[无HE组vs MHE组vs OHE组：2.00(1.11~91.61) vs 1.21(0.26~6.79) vs 0.09(0.01~0.92)，χ2=6.249，P=0.043](图 3)。
图 3 不同预后组TIPS术后粪球菌属变化量比较注：3组间菌群变化量有明显差异(χ2=6.249，P=0.043)，球菌属变化量在无HE组和MHE组中均明显高于OHE组(P值分别为0.021、0.050)，而无HE组与MHE组差异无统计学意义(P＞0.05)。3. 讨论
本研究通过16S rRNA测序的方法，开展了一项纵向观察性研究。描述MHE患者经TIPS术后不同脑病状态的患者肠道菌群的变化，探索术后菌群的改变与术后脑病程度关系。
TIPS术后，3组患者肠道菌群的alpha多样性无明显差异，总体菌群组成相似，可能与肝硬化失代偿期患者较差的菌群状态有关。术后无HE组患者，菌群失调好转，小杆菌属、粪球菌属、解黄酮菌属、瘤胃菌科某属、狭义梭菌属和假丁酸弧菌属增多，这些菌属多属于毛螺菌科和瘤胃菌科，是健康人体内的原生菌群，它们参与人肠道内碳水化合物发酵产生短链脂肪酸，减轻结肠炎症[12-15]，且与致病菌竞争营养，产生抗菌肽，可能改善肠道屏障[16-18]。这在克罗恩病和肝硬化的研究中均有所体现[17-18]。而有害菌如丹毒丝菌科未知属和颗粒链菌属减少。
对于MHE组患者，颗粒链菌属、肠球菌属、链球菌属和罗氏菌属丰度减低，而韦荣球菌属和巨球菌属(均属韦荣球菌科下级菌属)则升高。而OHE组患者仅有韦荣球菌属增多。颗粒链菌属和罗氏菌属是口腔和肠道菌群中的机会致病菌，肠球菌属在肝硬化患者和HE患者中富集，与MELD评分有显著的正相关性[8-9]。链球菌属和韦荣球菌属与肠道菌群失调以及较差的认知水平相关[19-20]。Bajaj[9]报道了与健康人相比肝硬化HE患者韦荣球菌科相对丰度明显更高。另外，既往文献[21-23]发现韦荣球菌属某些菌种参与了数种严重的炎症反应。
因此本研究推测，虽然TIPS术建立了新的门体分流道，使部分肠源性毒素可以直接从门静脉进入体循环，但是术后门静脉高压得到缓解，肠道微循环和肠道环境发生改变，从而对肠道菌群产生了一定的影响。(1)原生菌群丰度升高而有害菌丰度降低，肠道微生态恢复，产生的肠源性毒素减少，MHE患者的脑病状态得到改善；(2)有害菌/潜在致病菌有的增多有的减少，菌群状态未得到明显改善，隐性脑病状态未缓解；(3)脑病富集菌韦荣球菌属明显增多，菌群失调加重，患者发生OHE。同时本研究发现粪球菌属的变化量与术后脑病的严重程度呈负相关。说明了原生菌群的增多对TIPS术后患者预后有更为重要的影响。
本研究存在一定的局限性。首先样本量较小，需要大样本多中心研究对结果进行验证；第二，使用16S rRNA测序而不是宏基因组使研究不能深入到菌种水平进行分析；第三，研究未考虑环境因素、饮食以及药物使用如抗生素和质子泵抑制剂等的影响；同时，TIPS术对肠道微环境具体产生了什么样的作用，为什么会出现不同的肠道菌群改变，以及对于发生HE的患者，是菌群恶化造成脑病发生还是脑病发生导致菌群恶化仍需要进一步研究。
总的来说，本研究报道了经TIPS术后不同脑病状态的MHE患者肠道菌群的变化情况，发现肠道菌群失调状态的改善情况与术后脑病状态呈负相关。其中原生菌群的升高相对有更重要的作用。这为预防和治疗MHE患者术后脑病提供了微生物角度策略。
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