发布日期:2019-08-02
来源:本站原创
缺乏高度敏感和特异性的诊断生物标志物是肝细胞癌患者不良预后的主要原因。我们试图发展一种非侵入性诊断方法,即利用游离DNA(cfDNA)检测早期肝癌。
芝加哥大学何川教授、上海东方肝胆外科医院王红阳教授 、西北大学范伯格医学院Zhang Wei教授、复旦大学附属中山医院樊嘉教授等联合团队,应用5hmC-Seal技术对2544例中国受试者的游离DNA样本中的5-羟甲基胞嘧啶(5HMC)进行全基因组图谱的绘制(其中1204例肝癌患者、392例慢性乙型肝炎或肝硬化患者、958例健康或良性肝损伤人群。利用弹性网络正则化进行特征选择的病例对照分析,建立了早期肝癌的诊断模型。
来自肝癌患者的5hmC-Seal数据显示,在全基因组范围内分布着丰富的肝源性增强子标记。研究者建立了一个32基因诊断模型,根据巴塞罗那肝癌分期系统准确区分早期肝癌(0/A期)与非肝癌患者(曲线下面积=88.4%,95%CI:85.8%~91.1%),显示其优于甲胎蛋白。
除了可以检测早期肝癌或小肿瘤(如≤2.0 cm)外,5hmC模型在慢乙肝或肝硬化病史的高危受试者中发现早期肝癌的能力也显著优于AFP(曲线下面积=84.6%,95%CI:80.6%~88.7%)。
此外,5hmC诊断模型似乎不受潜在混杂因素(如吸烟、饮酒等)的影响。
综上,研究团队已经开发并验证了一种非侵入性方法,该方法具有早期检测肝癌的临床应用潜力,而检测到的肝癌在高危人群中仍然可以手术切除,不会延误治疗最佳时机。
(吉林大学第一医院感染病中心肝病科 冯丽娜 金清龙 报道)
芝加哥大学何川教授、上海东方肝胆外科医院王红阳教授 、西北大学范伯格医学院Zhang Wei教授、复旦大学附属中山医院樊嘉教授等联合团队,应用5hmC-Seal技术对2544例中国受试者的游离DNA样本中的5-羟甲基胞嘧啶(5HMC)进行全基因组图谱的绘制(其中1204例肝癌患者、392例慢性乙型肝炎或肝硬化患者、958例健康或良性肝损伤人群。利用弹性网络正则化进行特征选择的病例对照分析,建立了早期肝癌的诊断模型。
来自肝癌患者的5hmC-Seal数据显示,在全基因组范围内分布着丰富的肝源性增强子标记。研究者建立了一个32基因诊断模型,根据巴塞罗那肝癌分期系统准确区分早期肝癌(0/A期)与非肝癌患者(曲线下面积=88.4%,95%CI:85.8%~91.1%),显示其优于甲胎蛋白。
除了可以检测早期肝癌或小肿瘤(如≤2.0 cm)外,5hmC模型在慢乙肝或肝硬化病史的高危受试者中发现早期肝癌的能力也显著优于AFP(曲线下面积=84.6%,95%CI:80.6%~88.7%)。
此外,5hmC诊断模型似乎不受潜在混杂因素(如吸烟、饮酒等)的影响。
综上,研究团队已经开发并验证了一种非侵入性方法,该方法具有早期检测肝癌的临床应用潜力,而检测到的肝癌在高危人群中仍然可以手术切除,不会延误治疗最佳时机。
(吉林大学第一医院感染病中心肝病科 冯丽娜 金清龙 报道)